Rakovina: Tyto 4 geny pomáhají předvídat výsledek
Rozsáhlý výzkum role supresoru nádoru p53 nabízí lepší porozumění genetickým mutacím, které se hrají v různých formách rakoviny, a také identifikaci čtyř genů, které mohou pomoci předpovědět výhled člověka.
The TP53 Gen je zodpovědný za kódování toho, co vědci nazývají tumorový protein p53 - tumor supresor, který může zastavit příliš rychlé dělení a množení buněk.
Vědci dabovali TP53 „strážce genomu“ kvůli jeho zásadní roli v prevenci nádorů a udržování buněčného dělení pod kontrolou.
Lidské rakoviny často obsahují mutace v TP53 gen, což způsobilo selhání jednoho z kritických obranných mechanismů proti rakovině.
První studie, které identifikovaly TP53 mutace v lidských rakovinách se objevily v 80. letech a od té doby vědci věnovali mnoho času a zdrojů objasnění své role v rakovině.
Nyní největší studie svého druhu využívá vzorky nádorů od více než 10 000 pacientů s rakovinou a zkoumá 32 různých typů rakoviny, aby lépe pochopila roli TP53.
Dr. Larry Donehower, profesor molekulární virologie a mikrobiologie na Baylor College of Medicine v Houstonu, TX, vedl nový výzkum, který se objevuje v časopise Zprávy buněk.
Geny Telltale 4 mohou pomoci předpovědět výhled
Dr. Donehower a tým použili pět různých datových platforem k extrakci 10 225 vzorků z 32 rakovin. Pomocí Canlas Genome Atlas (TCGA) byli vědci schopni komplexně posoudit roli dráhy p53 u těchto 32 druhů rakoviny.
Dr. Donehower a kolegové poté porovnali data TCGA s jinou databází 80 000 genetických mutací, kterou Dr. Thierry Soussi - profesor molekulární biologie na univerzitě Sorbonne v Paříži ve Francii - shromáždil po dobu 30 let.
Vědci to zjistili TP53 mutace se vyskytovaly častěji u lidí, kteří měli horší výhled. Analýza dále zjistila, že „více než 91% případů rakoviny s TP53 mutace ukazují ztrátu obou funkčních TP53 alely, “nebo genové varianty.
Dr. Donehower vysvětluje: „U některých genů pro rakovinu uvidíte jednu kopii těchto dvou genů ztracených nebo mutovaných,“ ale „více než 91 procent všech druhů rakoviny ztrácí oba TP53 geny, ne jen jeden. “
K druhé ztrátě alely, jak píší autoři, došlo „mutací, delecí chromozomů nebo kopií neutrální ztrátou heterozygozity“ - tedy duplikací genů. Vedoucí výzkumník také poznamenává, že tento poslední proces se vyskytoval mnohem častěji, než se dříve domnívalo.
Důležité je, že výzkum také identifikoval čtyři geny, které vykazovaly nadměrnou expresi u mutantů TP53 nádory. Podle výzkumníků mohou tyto čtyři geny „říci“, zda má pacient s rakovinou dobrý výhled nebo ne.
"Pokud máte vysokou expresi těchto čtyř genů, máte pacienta, u kterého je větší pravděpodobnost špatné prognózy [...] Naopak, pokud má tento pacient velmi nízkou expresi těchto genů, pravděpodobně přežije déle a bude mít dobrá prognóza. “
Dr. Larry Donehower
"Poskytne vám lepší představu o tom, jak se mu bude dařit, než jen vědět, zda je pro něj mutant." TP53 nebo ne, “pokračuje Dr. Donehower.
Nakonec je studie silně spojena TP53 mutace s genomovou nestabilitou, nález, který je v souladu s TP53Typická role „strážce genomu“.
Dr. Donehower komentuje jedinečnost nového výzkumu slovy: „Většina studií o TP53 zaměřit se na jeden typ rakoviny. “
"Při pohledu na 32 různých typů rakoviny zjistíte, že určité vzorce obstojí bez ohledu na typ rakoviny."
Spoluautor studie a ředitel Cancer Genomics na Baylor College of Medicine, Dr. David Wheeler, také komentuje význam těchto zjištění.
Říká: „Od té doby TP53 je jedním z nejdůležitějších strážců v prevenci rakoviny, čím lépe porozumíme tomuto genu, tím lépe budeme schopni porozumět základní biologii rakoviny. To povede k lepším terapiím. “
