Prevence herpetických infekcí: Studie nabízí nové poznatky
Nový výzkum identifikuje klíčový faktor, který určuje progresi viru herpes a ukazuje, že jeho cílení může zpomalit progresi viru.
Podle nejnovějších statistik Centra pro kontrolu a prevenci nemocí (CDC) žilo v letech 2015–2016 ve Spojených státech téměř 48% lidí s herpes simplex 1, virovým kmenem, který způsobuje orální infekce.
Na celém světě má virus 80% populace. Jakmile ji člověk uzavře, virus nikdy nezmizí - zůstává v jeho těle po celý život v klidu.
Ačkoli příznaky herpesu někdy zůstávají bez povšimnutí, pro některé lidi mohou být nepříjemné a bolestivé.
Herpetický virus je také vysoce nakažlivý, protože člověk jej může přenášet, i když nemá žádné příznaky.
Nový výzkum naznačuje, že viru lze brzy zabránit, protože vědci nabízejí nové poznatky o tom, co se děje na buněčné úrovni během herpetické infekce, a najdou způsob, jak zpomalit průběh infekce.
Emanuel Wyler, Ph.D., a Vedran Franke, Ph.D., z berlínského Institutu pro biologii zdravotnických systémů v Německu, jsou spoluautory nového článku, který vyšel v časopise Příroda komunikace.
Význam transkripčního faktoru NRF2
Vědci vyvinuli algoritmus, který jim umožnil předpovědět, jak bude infekce postupovat v jednotlivých buňkách.
Vědci použili jednobuněčné RNA sekvenování k analýze 12 000 lidských kožních buněk infikovaných virem herpes simplex 1 (HSV1). Sekvenování jednobuněčné RNA je revoluční technika, která umožňuje rozložení genetických výrazů na mnohem granulárnější úrovni než hromadné sekvenování RNA.
Vědci vysvětlují rozdíl mezi sekvenováním jedné buňky RNA a konvenčním hromadným sekvenováním RNA pomocí analogie smoothie.
"Pokud do mixéru vložím deset druhů ovoce, mohu zhruba říct, že smoothie obsahuje řekněme ostružiny, když ji ochutnám," vysvětluje Wyler. "Se sekvenováním jednobuněčné RNA neděláme smoothie - děláme ovocný salát." Okamžitě dokážu identifikovat ostružiny a přesně říci, kolik jich je v salátu. “
Tato technika v kombinaci s algoritmem odhalila vědcům, že transkripční faktor zvaný NRF2 hraje klíčovou roli, přičemž jeho aktivace inhibuje progresi infekce.
Transkripční faktory jsou proteiny, které „dekódují“ informace z našeho genomu a aktivují nebo deaktivují specifické geny vazbou na určité oblasti DNA.
Franke vysvětluje, jak nová technika odhalila význam transkripčního faktoru NRF2.
"Vizualizoval jsem změny v regulaci každého genu, který jsme zkoumali, v jedné buňce," říká. "To nám ukázalo, že úroveň aktivace transkripčního faktoru NRF2 může být markerem dočasné rezistence na infekci HSV1."
Vědci také zjistili, že dva agonisté NRF2 nebo aktivátory, které se nazývají bardoxolon methyl a sulforafan, zhoršují produkci viru, to znamená, že způsobují, že virus aktivuje méně vlastních genů. To vědcům potvrdilo klíčovou roli NRF2.
Bardoxolone methyl je lék určený k léčbě chronické infekce ledvin. V současné době je ve třetí fázi klinických studií.
Studie nakonec odhalila, že fáze buněčného cyklu také ovlivňuje, jak zranitelná je buňka vůči infekci HSV1.
Vědci vysvětlují, že herpes virus je dobrým „obecným plánem“ pro vyšetřování buněčných stavů virových infekcí a plánují použití sekvenování jednobuněčné RNA ke studiu budoucích virů.
